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Oft werden verschiedene mikrobiologische Verfahren kombiniert, um qualitativ besonders hochwertige Lebensmittel zu erzeugen. Dabei werden oft Edelpilze eingesetzt, die sowohl Aromen erzeugen als auch die Oberflächen der Produkte gestalten. Besonders in Asien werden Pilze wie Aspergillus oryzae und Rhizopus oligosporus in verschiedenen Verfahren (z.B Herstellung von Reiswein, Tempeh, Koji, Sojasauce) eingesetzt.
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